Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms