Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
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