Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SSX1Q16384 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms