Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC6Q16204 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms