Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
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