Protein–RNA interactions for Protein: Q15846

CLUL1, Clusterin-like protein 1, humanhuman

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Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLUL1Q15846 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLUL1Q15846 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLUL1Q15846 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLUL1Q15846 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLUL1Q15846 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLUL1Q15846 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLUL1Q15846 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLUL1Q15846 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLUL1Q15846 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLUL1Q15846 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLUL1Q15846 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CLUL1Q15846 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CLUL1Q15846 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLUL1Q15846 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLUL1Q15846 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLUL1Q15846 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLUL1Q15846 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLUL1Q15846 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLUL1Q15846 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLUL1Q15846 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLUL1Q15846 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLUL1Q15846 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLUL1Q15846 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLUL1Q15846 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLUL1Q15846 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CLUL1Q15846 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CLUL1Q15846 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLUL1Q15846 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CLUL1Q15846 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLUL1Q15846 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLUL1Q15846 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLUL1Q15846 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLUL1Q15846 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLUL1Q15846 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLUL1Q15846 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLUL1Q15846 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLUL1Q15846 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLUL1Q15846 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLUL1Q15846 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLUL1Q15846 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLUL1Q15846 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLUL1Q15846 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLUL1Q15846 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLUL1Q15846 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLUL1Q15846 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLUL1Q15846 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLUL1Q15846 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLUL1Q15846 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLUL1Q15846 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLUL1Q15846 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLUL1Q15846 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLUL1Q15846 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLUL1Q15846 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLUL1Q15846 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLUL1Q15846 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLUL1Q15846 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLUL1Q15846 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLUL1Q15846 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLUL1Q15846 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLUL1Q15846 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLUL1Q15846 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLUL1Q15846 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLUL1Q15846 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CLUL1Q15846 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLUL1Q15846 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CLUL1Q15846 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLUL1Q15846 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CLUL1Q15846 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLUL1Q15846 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLUL1Q15846 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CLUL1Q15846 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLUL1Q15846 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLUL1Q15846 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLUL1Q15846 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLUL1Q15846 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLUL1Q15846 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLUL1Q15846 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLUL1Q15846 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLUL1Q15846 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLUL1Q15846 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLUL1Q15846 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLUL1Q15846 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLUL1Q15846 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLUL1Q15846 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLUL1Q15846 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLUL1Q15846 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLUL1Q15846 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLUL1Q15846 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLUL1Q15846 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLUL1Q15846 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLUL1Q15846 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLUL1Q15846 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLUL1Q15846 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLUL1Q15846 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CLUL1Q15846 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLUL1Q15846 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLUL1Q15846 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLUL1Q15846 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLUL1Q15846 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLUL1Q15846 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms