Protein–RNA interactions for Protein: Q15286

RAB35, Ras-related protein Rab-35, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB35Q15286 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB35Q15286 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB35Q15286 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB35Q15286 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB35Q15286 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB35Q15286 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB35Q15286 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB35Q15286 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB35Q15286 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB35Q15286 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB35Q15286 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB35Q15286 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB35Q15286 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB35Q15286 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB35Q15286 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB35Q15286 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB35Q15286 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB35Q15286 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB35Q15286 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB35Q15286 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB35Q15286 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB35Q15286 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB35Q15286 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB35Q15286 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB35Q15286 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB35Q15286 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB35Q15286 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB35Q15286 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB35Q15286 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB35Q15286 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB35Q15286 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB35Q15286 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB35Q15286 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB35Q15286 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB35Q15286 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB35Q15286 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB35Q15286 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB35Q15286 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB35Q15286 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB35Q15286 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB35Q15286 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB35Q15286 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB35Q15286 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB35Q15286 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB35Q15286 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB35Q15286 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB35Q15286 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB35Q15286 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB35Q15286 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB35Q15286 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB35Q15286 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB35Q15286 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB35Q15286 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB35Q15286 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB35Q15286 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB35Q15286 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB35Q15286 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB35Q15286 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB35Q15286 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB35Q15286 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB35Q15286 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB35Q15286 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB35Q15286 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB35Q15286 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB35Q15286 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB35Q15286 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB35Q15286 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB35Q15286 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB35Q15286 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB35Q15286 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB35Q15286 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB35Q15286 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB35Q15286 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB35Q15286 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB35Q15286 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB35Q15286 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB35Q15286 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB35Q15286 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB35Q15286 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB35Q15286 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB35Q15286 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB35Q15286 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB35Q15286 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB35Q15286 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB35Q15286 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB35Q15286 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB35Q15286 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB35Q15286 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB35Q15286 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB35Q15286 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB35Q15286 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB35Q15286 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB35Q15286 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB35Q15286 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB35Q15286 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB35Q15286 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB35Q15286 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB35Q15286 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB35Q15286 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB35Q15286 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76 ms