Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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