Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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