Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NCAPHQ15003 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
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