Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms