Protein–RNA interactions for Protein: Q14264

ERV3-1, Endogenous retrovirus group 3 member 1 Env polyprotein, humanhuman

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERV3-1Q14264 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERV3-1Q14264 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERV3-1Q14264 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERV3-1Q14264 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERV3-1Q14264 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ERV3-1Q14264 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERV3-1Q14264 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERV3-1Q14264 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ERV3-1Q14264 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERV3-1Q14264 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERV3-1Q14264 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERV3-1Q14264 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERV3-1Q14264 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERV3-1Q14264 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERV3-1Q14264 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERV3-1Q14264 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERV3-1Q14264 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERV3-1Q14264 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERV3-1Q14264 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERV3-1Q14264 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERV3-1Q14264 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERV3-1Q14264 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERV3-1Q14264 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERV3-1Q14264 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERV3-1Q14264 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERV3-1Q14264 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERV3-1Q14264 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERV3-1Q14264 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERV3-1Q14264 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERV3-1Q14264 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERV3-1Q14264 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERV3-1Q14264 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERV3-1Q14264 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERV3-1Q14264 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERV3-1Q14264 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERV3-1Q14264 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERV3-1Q14264 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERV3-1Q14264 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERV3-1Q14264 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERV3-1Q14264 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERV3-1Q14264 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERV3-1Q14264 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERV3-1Q14264 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERV3-1Q14264 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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ERV3-1Q14264 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERV3-1Q14264 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERV3-1Q14264 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERV3-1Q14264 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERV3-1Q14264 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERV3-1Q14264 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERV3-1Q14264 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERV3-1Q14264 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERV3-1Q14264 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERV3-1Q14264 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERV3-1Q14264 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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ERV3-1Q14264 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERV3-1Q14264 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERV3-1Q14264 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERV3-1Q14264 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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ERV3-1Q14264 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERV3-1Q14264 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERV3-1Q14264 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ERV3-1Q14264 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERV3-1Q14264 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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ERV3-1Q14264 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ERV3-1Q14264 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERV3-1Q14264 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ERV3-1Q14264 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ERV3-1Q14264 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ERV3-1Q14264 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ERV3-1Q14264 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ERV3-1Q14264 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ERV3-1Q14264 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ERV3-1Q14264 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ERV3-1Q14264 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ERV3-1Q14264 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
ERV3-1Q14264 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ERV3-1Q14264 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ERV3-1Q14264 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ERV3-1Q14264 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ERV3-1Q14264 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERV3-1Q14264 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERV3-1Q14264 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERV3-1Q14264 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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