Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CDK13Q14004 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CDK13Q14004 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CDK13Q14004 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDK13Q14004 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDK13Q14004 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDK13Q14004 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDK13Q14004 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDK13Q14004 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CDK13Q14004 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDK13Q14004 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDK13Q14004 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDK13Q14004 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDK13Q14004 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CDK13Q14004 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDK13Q14004 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDK13Q14004 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDK13Q14004 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDK13Q14004 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDK13Q14004 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDK13Q14004 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDK13Q14004 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDK13Q14004 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CDK13Q14004 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CDK13Q14004 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDK13Q14004 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CDK13Q14004 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDK13Q14004 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDK13Q14004 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDK13Q14004 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDK13Q14004 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDK13Q14004 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDK13Q14004 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDK13Q14004 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDK13Q14004 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDK13Q14004 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDK13Q14004 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDK13Q14004 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDK13Q14004 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDK13Q14004 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CDK13Q14004 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDK13Q14004 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDK13Q14004 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDK13Q14004 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDK13Q14004 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDK13Q14004 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDK13Q14004 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDK13Q14004 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDK13Q14004 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDK13Q14004 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDK13Q14004 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDK13Q14004 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDK13Q14004 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDK13Q14004 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDK13Q14004 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDK13Q14004 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDK13Q14004 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDK13Q14004 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDK13Q14004 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDK13Q14004 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDK13Q14004 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDK13Q14004 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDK13Q14004 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDK13Q14004 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDK13Q14004 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDK13Q14004 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDK13Q14004 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDK13Q14004 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CDK13Q14004 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDK13Q14004 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CDK13Q14004 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDK13Q14004 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDK13Q14004 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDK13Q14004 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CDK13Q14004 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDK13Q14004 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CDK13Q14004 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDK13Q14004 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDK13Q14004 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDK13Q14004 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDK13Q14004 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CDK13Q14004 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDK13Q14004 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDK13Q14004 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDK13Q14004 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDK13Q14004 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDK13Q14004 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDK13Q14004 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CDK13Q14004 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDK13Q14004 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDK13Q14004 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDK13Q14004 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDK13Q14004 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDK13Q14004 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDK13Q14004 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDK13Q14004 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDK13Q14004 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDK13Q14004 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDK13Q14004 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDK13Q14004 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
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