Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms