Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
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