Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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