Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

Predictions only

Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATRQ13535 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATRQ13535 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATRQ13535 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATRQ13535 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
ATRQ13535 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATRQ13535 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATRQ13535 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
ATRQ13535 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATRQ13535 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
ATRQ13535 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATRQ13535 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATRQ13535 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATRQ13535 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATRQ13535 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATRQ13535 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATRQ13535 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATRQ13535 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
ATRQ13535 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATRQ13535 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATRQ13535 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATRQ13535 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
ATRQ13535 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATRQ13535 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATRQ13535 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATRQ13535 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ATRQ13535 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
ATRQ13535 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ATRQ13535 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ATRQ13535 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ATRQ13535 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ATRQ13535 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ATRQ13535 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ATRQ13535 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ATRQ13535 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ATRQ13535 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ATRQ13535 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ATRQ13535 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ATRQ13535 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ATRQ13535 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ATRQ13535 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ATRQ13535 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ATRQ13535 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ATRQ13535 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ATRQ13535 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ATRQ13535 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ATRQ13535 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ATRQ13535 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ATRQ13535 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ATRQ13535 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ATRQ13535 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ATRQ13535 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ATRQ13535 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ATRQ13535 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ATRQ13535 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ATRQ13535 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ATRQ13535 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ATRQ13535 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ATRQ13535 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ATRQ13535 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ATRQ13535 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ATRQ13535 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ATRQ13535 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ATRQ13535 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ATRQ13535 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ATRQ13535 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ATRQ13535 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ATRQ13535 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ATRQ13535 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ATRQ13535 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ATRQ13535 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ATRQ13535 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
ATRQ13535 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ATRQ13535 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
ATRQ13535 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
ATRQ13535 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ATRQ13535 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ATRQ13535 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ATRQ13535 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ATRQ13535 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ATRQ13535 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ATRQ13535 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ATRQ13535 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ATRQ13535 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ATRQ13535 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ATRQ13535 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
ATRQ13535 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ATRQ13535 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
ATRQ13535 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ATRQ13535 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ATRQ13535 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
ATRQ13535 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ATRQ13535 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
ATRQ13535 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
ATRQ13535 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ATRQ13535 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ATRQ13535 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ATRQ13535 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ATRQ13535 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ATRQ13535 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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