Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms