Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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