Protein–RNA interactions for Protein: Q08397

LOXL1, Lysyl oxidase homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL1Q08397 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LOXL1Q08397 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LOXL1Q08397 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LOXL1Q08397 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LOXL1Q08397 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LOXL1Q08397 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LOXL1Q08397 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LOXL1Q08397 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LOXL1Q08397 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LOXL1Q08397 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LOXL1Q08397 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.9 ms