Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms