Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBE3AQ05086 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms