Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2F1Q01094 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms