Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLTCQ00610 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLTCQ00610 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLTCQ00610 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLTCQ00610 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLTCQ00610 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLTCQ00610 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLTCQ00610 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLTCQ00610 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CLTCQ00610 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLTCQ00610 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CLTCQ00610 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLTCQ00610 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLTCQ00610 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLTCQ00610 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLTCQ00610 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLTCQ00610 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLTCQ00610 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLTCQ00610 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLTCQ00610 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLTCQ00610 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CLTCQ00610 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CLTCQ00610 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLTCQ00610 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLTCQ00610 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLTCQ00610 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLTCQ00610 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLTCQ00610 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLTCQ00610 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CLTCQ00610 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLTCQ00610 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLTCQ00610 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLTCQ00610 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLTCQ00610 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLTCQ00610 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLTCQ00610 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLTCQ00610 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLTCQ00610 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLTCQ00610 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLTCQ00610 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLTCQ00610 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLTCQ00610 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLTCQ00610 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLTCQ00610 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLTCQ00610 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLTCQ00610 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLTCQ00610 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CLTCQ00610 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLTCQ00610 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLTCQ00610 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLTCQ00610 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLTCQ00610 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLTCQ00610 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLTCQ00610 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CLTCQ00610 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CLTCQ00610 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLTCQ00610 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLTCQ00610 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLTCQ00610 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLTCQ00610 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLTCQ00610 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLTCQ00610 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLTCQ00610 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLTCQ00610 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLTCQ00610 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CLTCQ00610 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLTCQ00610 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLTCQ00610 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLTCQ00610 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLTCQ00610 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLTCQ00610 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLTCQ00610 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLTCQ00610 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CLTCQ00610 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CLTCQ00610 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLTCQ00610 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLTCQ00610 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLTCQ00610 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLTCQ00610 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLTCQ00610 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLTCQ00610 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLTCQ00610 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLTCQ00610 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLTCQ00610 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLTCQ00610 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLTCQ00610 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLTCQ00610 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLTCQ00610 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLTCQ00610 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLTCQ00610 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLTCQ00610 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLTCQ00610 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLTCQ00610 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLTCQ00610 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CLTCQ00610 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLTCQ00610 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLTCQ00610 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CLTCQ00610 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLTCQ00610 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLTCQ00610 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms