Protein–RNA interactions for Protein: Q00534

CDK6, Cyclin-dependent kinase 6, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK6Q00534 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK6Q00534 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms