Protein–RNA interactions for Protein: P68366

TUBA4A, Tubulin alpha-4A chain, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA4AP68366 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBA4AP68366 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms