Protein–RNA interactions for Protein: P61565

ERVK-21, Endogenous retrovirus group K member 21 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-21P61565 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVK-21P61565 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ERVK-21P61565 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
ERVK-21P61565 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVK-21P61565 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVK-21P61565 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVK-21P61565 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVK-21P61565 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVK-21P61565 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVK-21P61565 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVK-21P61565 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVK-21P61565 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVK-21P61565 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVK-21P61565 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVK-21P61565 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVK-21P61565 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVK-21P61565 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVK-21P61565 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVK-21P61565 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVK-21P61565 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVK-21P61565 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVK-21P61565 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVK-21P61565 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVK-21P61565 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVK-21P61565 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVK-21P61565 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVK-21P61565 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms