Protein–RNA interactions for Protein: P57773

GJA9, Gap junction alpha-9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA9P57773 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GJA9P57773 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GJA9P57773 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GJA9P57773 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GJA9P57773 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GJA9P57773 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GJA9P57773 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GJA9P57773 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GJA9P57773 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GJA9P57773 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GJA9P57773 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GJA9P57773 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GJA9P57773 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GJA9P57773 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GJA9P57773 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GJA9P57773 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GJA9P57773 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GJA9P57773 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GJA9P57773 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GJA9P57773 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GJA9P57773 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GJA9P57773 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GJA9P57773 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GJA9P57773 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GJA9P57773 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GJA9P57773 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GJA9P57773 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GJA9P57773 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GJA9P57773 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GJA9P57773 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GJA9P57773 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GJA9P57773 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
GJA9P57773 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GJA9P57773 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GJA9P57773 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GJA9P57773 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GJA9P57773 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GJA9P57773 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GJA9P57773 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GJA9P57773 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GJA9P57773 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
GJA9P57773 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GJA9P57773 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GJA9P57773 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GJA9P57773 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GJA9P57773 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GJA9P57773 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
GJA9P57773 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GJA9P57773 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GJA9P57773 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GJA9P57773 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
GJA9P57773 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GJA9P57773 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GJA9P57773 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GJA9P57773 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GJA9P57773 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GJA9P57773 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GJA9P57773 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
GJA9P57773 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GJA9P57773 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GJA9P57773 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GJA9P57773 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GJA9P57773 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GJA9P57773 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GJA9P57773 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJA9P57773 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJA9P57773 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJA9P57773 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJA9P57773 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJA9P57773 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJA9P57773 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJA9P57773 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJA9P57773 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJA9P57773 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJA9P57773 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJA9P57773 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJA9P57773 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJA9P57773 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJA9P57773 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJA9P57773 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJA9P57773 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJA9P57773 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJA9P57773 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJA9P57773 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJA9P57773 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJA9P57773 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJA9P57773 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJA9P57773 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJA9P57773 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GJA9P57773 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJA9P57773 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJA9P57773 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJA9P57773 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJA9P57773 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJA9P57773 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJA9P57773 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJA9P57773 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJA9P57773 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJA9P57773 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJA9P57773 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms