Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms