Protein–RNA interactions for Protein: P54289

CACNA2D1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1P54289 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms