Protein–RNA interactions for Protein: P51571

SSR4, Translocon-associated protein subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR4P51571 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SSR4P51571 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SSR4P51571 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SSR4P51571 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSR4P51571 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSR4P51571 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSR4P51571 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSR4P51571 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSR4P51571 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSR4P51571 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSR4P51571 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSR4P51571 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSR4P51571 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSR4P51571 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSR4P51571 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSR4P51571 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSR4P51571 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSR4P51571 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSR4P51571 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSR4P51571 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSR4P51571 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSR4P51571 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSR4P51571 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSR4P51571 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSR4P51571 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSR4P51571 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSR4P51571 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSR4P51571 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSR4P51571 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSR4P51571 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSR4P51571 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSR4P51571 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSR4P51571 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSR4P51571 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SSR4P51571 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSR4P51571 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SSR4P51571 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSR4P51571 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSR4P51571 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSR4P51571 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSR4P51571 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SSR4P51571 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SSR4P51571 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SSR4P51571 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSR4P51571 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSR4P51571 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSR4P51571 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSR4P51571 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSR4P51571 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSR4P51571 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSR4P51571 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSR4P51571 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSR4P51571 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSR4P51571 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSR4P51571 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSR4P51571 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSR4P51571 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSR4P51571 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSR4P51571 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSR4P51571 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSR4P51571 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSR4P51571 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSR4P51571 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSR4P51571 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSR4P51571 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSR4P51571 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SSR4P51571 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSR4P51571 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSR4P51571 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSR4P51571 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSR4P51571 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSR4P51571 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSR4P51571 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSR4P51571 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSR4P51571 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSR4P51571 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SSR4P51571 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSR4P51571 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SSR4P51571 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSR4P51571 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSR4P51571 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSR4P51571 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSR4P51571 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSR4P51571 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSR4P51571 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSR4P51571 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSR4P51571 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSR4P51571 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSR4P51571 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SSR4P51571 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSR4P51571 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSR4P51571 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSR4P51571 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSR4P51571 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSR4P51571 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSR4P51571 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSR4P51571 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSR4P51571 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSR4P51571 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSR4P51571 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms