Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DAP3P51398 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DAP3P51398 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DAP3P51398 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DAP3P51398 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DAP3P51398 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
DAP3P51398 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DAP3P51398 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DAP3P51398 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DAP3P51398 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DAP3P51398 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
DAP3P51398 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DAP3P51398 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DAP3P51398 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DAP3P51398 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DAP3P51398 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DAP3P51398 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
DAP3P51398 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DAP3P51398 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
DAP3P51398 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DAP3P51398 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
DAP3P51398 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DAP3P51398 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DAP3P51398 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DAP3P51398 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DAP3P51398 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DAP3P51398 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DAP3P51398 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DAP3P51398 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DAP3P51398 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DAP3P51398 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DAP3P51398 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DAP3P51398 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DAP3P51398 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DAP3P51398 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DAP3P51398 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DAP3P51398 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DAP3P51398 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DAP3P51398 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
DAP3P51398 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DAP3P51398 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
DAP3P51398 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DAP3P51398 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DAP3P51398 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DAP3P51398 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DAP3P51398 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DAP3P51398 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DAP3P51398 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DAP3P51398 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DAP3P51398 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DAP3P51398 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DAP3P51398 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DAP3P51398 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DAP3P51398 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DAP3P51398 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DAP3P51398 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
DAP3P51398 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DAP3P51398 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DAP3P51398 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
DAP3P51398 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DAP3P51398 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DAP3P51398 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
DAP3P51398 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DAP3P51398 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DAP3P51398 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DAP3P51398 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DAP3P51398 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
DAP3P51398 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DAP3P51398 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DAP3P51398 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DAP3P51398 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DAP3P51398 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DAP3P51398 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DAP3P51398 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DAP3P51398 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DAP3P51398 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DAP3P51398 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DAP3P51398 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DAP3P51398 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DAP3P51398 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DAP3P51398 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DAP3P51398 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DAP3P51398 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DAP3P51398 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DAP3P51398 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DAP3P51398 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
DAP3P51398 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DAP3P51398 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DAP3P51398 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DAP3P51398 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DAP3P51398 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DAP3P51398 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DAP3P51398 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DAP3P51398 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DAP3P51398 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DAP3P51398 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DAP3P51398 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DAP3P51398 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
DAP3P51398 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DAP3P51398 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms