Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TAF6P49848 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TAF6P49848 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TAF6P49848 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TAF6P49848 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TAF6P49848 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TAF6P49848 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TAF6P49848 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TAF6P49848 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TAF6P49848 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TAF6P49848 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TAF6P49848 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TAF6P49848 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TAF6P49848 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TAF6P49848 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TAF6P49848 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TAF6P49848 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TAF6P49848 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TAF6P49848 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TAF6P49848 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TAF6P49848 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TAF6P49848 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TAF6P49848 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TAF6P49848 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TAF6P49848 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TAF6P49848 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TAF6P49848 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TAF6P49848 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TAF6P49848 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TAF6P49848 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TAF6P49848 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TAF6P49848 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TAF6P49848 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TAF6P49848 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TAF6P49848 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TAF6P49848 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TAF6P49848 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TAF6P49848 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TAF6P49848 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TAF6P49848 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TAF6P49848 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TAF6P49848 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TAF6P49848 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TAF6P49848 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TAF6P49848 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TAF6P49848 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TAF6P49848 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TAF6P49848 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TAF6P49848 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TAF6P49848 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TAF6P49848 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TAF6P49848 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TAF6P49848 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TAF6P49848 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TAF6P49848 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TAF6P49848 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TAF6P49848 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TAF6P49848 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TAF6P49848 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TAF6P49848 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TAF6P49848 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TAF6P49848 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TAF6P49848 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TAF6P49848 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TAF6P49848 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TAF6P49848 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TAF6P49848 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TAF6P49848 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TAF6P49848 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TAF6P49848 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TAF6P49848 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TAF6P49848 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TAF6P49848 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TAF6P49848 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TAF6P49848 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TAF6P49848 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TAF6P49848 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TAF6P49848 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TAF6P49848 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TAF6P49848 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TAF6P49848 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TAF6P49848 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TAF6P49848 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TAF6P49848 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TAF6P49848 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TAF6P49848 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TAF6P49848 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TAF6P49848 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TAF6P49848 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TAF6P49848 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TAF6P49848 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TAF6P49848 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TAF6P49848 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TAF6P49848 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TAF6P49848 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TAF6P49848 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TAF6P49848 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TAF6P49848 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TAF6P49848 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
TAF6P49848 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms