Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TTPAP49638 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TTPAP49638 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TTPAP49638 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TTPAP49638 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TTPAP49638 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TTPAP49638 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TTPAP49638 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TTPAP49638 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TTPAP49638 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TTPAP49638 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TTPAP49638 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TTPAP49638 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TTPAP49638 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TTPAP49638 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TTPAP49638 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TTPAP49638 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TTPAP49638 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TTPAP49638 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TTPAP49638 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TTPAP49638 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TTPAP49638 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TTPAP49638 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TTPAP49638 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TTPAP49638 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TTPAP49638 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TTPAP49638 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TTPAP49638 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TTPAP49638 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TTPAP49638 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TTPAP49638 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TTPAP49638 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TTPAP49638 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TTPAP49638 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TTPAP49638 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TTPAP49638 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TTPAP49638 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TTPAP49638 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TTPAP49638 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TTPAP49638 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TTPAP49638 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TTPAP49638 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TTPAP49638 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TTPAP49638 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TTPAP49638 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TTPAP49638 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TTPAP49638 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TTPAP49638 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TTPAP49638 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TTPAP49638 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TTPAP49638 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TTPAP49638 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TTPAP49638 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TTPAP49638 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TTPAP49638 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TTPAP49638 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TTPAP49638 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TTPAP49638 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TTPAP49638 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TTPAP49638 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TTPAP49638 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TTPAP49638 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TTPAP49638 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TTPAP49638 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TTPAP49638 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TTPAP49638 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TTPAP49638 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TTPAP49638 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TTPAP49638 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TTPAP49638 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TTPAP49638 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TTPAP49638 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TTPAP49638 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TTPAP49638 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TTPAP49638 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TTPAP49638 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TTPAP49638 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TTPAP49638 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TTPAP49638 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TTPAP49638 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TTPAP49638 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TTPAP49638 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TTPAP49638 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TTPAP49638 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TTPAP49638 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TTPAP49638 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TTPAP49638 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TTPAP49638 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TTPAP49638 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TTPAP49638 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TTPAP49638 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TTPAP49638 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TTPAP49638 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TTPAP49638 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TTPAP49638 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TTPAP49638 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TTPAP49638 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TTPAP49638 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TTPAP49638 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TTPAP49638 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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