Protein–RNA interactions for Protein: P36222

CHI3L1, Chitinase-3-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHI3L1P36222 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms