Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
HOXD13P35453 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXD13P35453 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms