Protein–RNA interactions for Protein: P35398

RORA, Nuclear receptor ROR-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RORAP35398 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RORAP35398 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RORAP35398 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RORAP35398 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RORAP35398 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RORAP35398 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RORAP35398 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RORAP35398 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RORAP35398 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RORAP35398 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RORAP35398 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RORAP35398 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RORAP35398 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RORAP35398 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RORAP35398 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RORAP35398 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RORAP35398 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RORAP35398 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RORAP35398 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RORAP35398 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RORAP35398 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RORAP35398 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RORAP35398 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RORAP35398 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RORAP35398 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RORAP35398 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RORAP35398 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RORAP35398 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RORAP35398 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RORAP35398 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RORAP35398 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RORAP35398 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RORAP35398 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RORAP35398 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RORAP35398 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RORAP35398 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RORAP35398 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RORAP35398 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RORAP35398 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RORAP35398 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RORAP35398 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RORAP35398 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RORAP35398 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RORAP35398 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RORAP35398 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RORAP35398 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RORAP35398 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RORAP35398 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RORAP35398 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RORAP35398 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RORAP35398 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RORAP35398 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RORAP35398 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RORAP35398 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RORAP35398 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RORAP35398 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RORAP35398 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RORAP35398 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RORAP35398 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RORAP35398 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RORAP35398 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RORAP35398 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RORAP35398 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RORAP35398 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RORAP35398 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RORAP35398 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RORAP35398 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RORAP35398 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RORAP35398 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RORAP35398 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RORAP35398 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RORAP35398 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RORAP35398 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RORAP35398 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RORAP35398 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RORAP35398 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RORAP35398 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RORAP35398 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RORAP35398 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RORAP35398 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RORAP35398 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RORAP35398 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RORAP35398 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RORAP35398 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RORAP35398 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RORAP35398 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RORAP35398 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RORAP35398 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RORAP35398 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RORAP35398 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RORAP35398 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RORAP35398 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RORAP35398 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RORAP35398 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RORAP35398 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RORAP35398 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RORAP35398 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RORAP35398 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RORAP35398 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RORAP35398 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms