Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTNNB1P35222 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms