Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms