Protein–RNA interactions for Protein: P28330

ACADL, Long-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADLP28330 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACADLP28330 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACADLP28330 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACADLP28330 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACADLP28330 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACADLP28330 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACADLP28330 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACADLP28330 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACADLP28330 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACADLP28330 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACADLP28330 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACADLP28330 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACADLP28330 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACADLP28330 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACADLP28330 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACADLP28330 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACADLP28330 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACADLP28330 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACADLP28330 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACADLP28330 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACADLP28330 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACADLP28330 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACADLP28330 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACADLP28330 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACADLP28330 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACADLP28330 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACADLP28330 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACADLP28330 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACADLP28330 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACADLP28330 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACADLP28330 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACADLP28330 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACADLP28330 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACADLP28330 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACADLP28330 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACADLP28330 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACADLP28330 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACADLP28330 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ACADLP28330 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACADLP28330 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ACADLP28330 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACADLP28330 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ACADLP28330 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACADLP28330 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACADLP28330 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ACADLP28330 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ACADLP28330 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACADLP28330 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACADLP28330 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACADLP28330 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACADLP28330 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACADLP28330 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACADLP28330 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACADLP28330 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACADLP28330 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ACADLP28330 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACADLP28330 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACADLP28330 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ACADLP28330 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACADLP28330 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACADLP28330 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACADLP28330 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACADLP28330 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACADLP28330 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACADLP28330 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACADLP28330 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACADLP28330 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACADLP28330 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACADLP28330 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACADLP28330 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACADLP28330 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACADLP28330 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACADLP28330 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACADLP28330 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACADLP28330 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACADLP28330 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACADLP28330 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ACADLP28330 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACADLP28330 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACADLP28330 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ACADLP28330 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACADLP28330 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACADLP28330 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACADLP28330 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ACADLP28330 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACADLP28330 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACADLP28330 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACADLP28330 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACADLP28330 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACADLP28330 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACADLP28330 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ACADLP28330 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACADLP28330 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACADLP28330 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACADLP28330 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACADLP28330 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACADLP28330 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACADLP28330 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACADLP28330 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACADLP28330 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms