Protein–RNA interactions for Protein: P24347

MMP11, Stromelysin-3, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP11P24347 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MMP11P24347 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
MMP11P24347 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
MMP11P24347 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
MMP11P24347 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MMP11P24347 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MMP11P24347 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MMP11P24347 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MMP11P24347 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MMP11P24347 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MMP11P24347 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MMP11P24347 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
MMP11P24347 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MMP11P24347 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MMP11P24347 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MMP11P24347 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MMP11P24347 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MMP11P24347 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MMP11P24347 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MMP11P24347 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MMP11P24347 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MMP11P24347 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
MMP11P24347 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MMP11P24347 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MMP11P24347 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MMP11P24347 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MMP11P24347 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MMP11P24347 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MMP11P24347 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MMP11P24347 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MMP11P24347 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MMP11P24347 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MMP11P24347 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MMP11P24347 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MMP11P24347 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MMP11P24347 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MMP11P24347 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MMP11P24347 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MMP11P24347 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MMP11P24347 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MMP11P24347 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MMP11P24347 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MMP11P24347 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MMP11P24347 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MMP11P24347 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MMP11P24347 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MMP11P24347 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MMP11P24347 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MMP11P24347 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MMP11P24347 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MMP11P24347 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MMP11P24347 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MMP11P24347 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MMP11P24347 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MMP11P24347 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MMP11P24347 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MMP11P24347 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MMP11P24347 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MMP11P24347 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MMP11P24347 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MMP11P24347 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MMP11P24347 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MMP11P24347 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MMP11P24347 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MMP11P24347 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MMP11P24347 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MMP11P24347 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MMP11P24347 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MMP11P24347 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MMP11P24347 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MMP11P24347 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MMP11P24347 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MMP11P24347 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MMP11P24347 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MMP11P24347 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MMP11P24347 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MMP11P24347 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MMP11P24347 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MMP11P24347 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MMP11P24347 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MMP11P24347 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MMP11P24347 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MMP11P24347 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MMP11P24347 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
MMP11P24347 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
MMP11P24347 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
MMP11P24347 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MMP11P24347 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MMP11P24347 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MMP11P24347 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MMP11P24347 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MMP11P24347 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
MMP11P24347 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MMP11P24347 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MMP11P24347 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MMP11P24347 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MMP11P24347 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MMP11P24347 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MMP11P24347 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MMP11P24347 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms