Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPREP23469 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPREP23469 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPREP23469 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPREP23469 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPREP23469 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPREP23469 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPREP23469 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPREP23469 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPREP23469 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPREP23469 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPREP23469 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPREP23469 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPREP23469 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPREP23469 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPREP23469 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPREP23469 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPREP23469 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPREP23469 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPREP23469 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPREP23469 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPREP23469 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPREP23469 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPREP23469 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPREP23469 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPREP23469 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPREP23469 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPREP23469 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPREP23469 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPREP23469 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPREP23469 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPREP23469 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPREP23469 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPREP23469 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPREP23469 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPREP23469 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPREP23469 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPREP23469 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.74
PTPREP23469 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PTPREP23469 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PTPREP23469 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PTPREP23469 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC19.64■□□□□ 0.74
PTPREP23469 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PTPREP23469 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPREP23469 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPREP23469 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPREP23469 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPREP23469 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPREP23469 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPREP23469 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPREP23469 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPREP23469 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPREP23469 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPREP23469 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPREP23469 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPREP23469 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPREP23469 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPREP23469 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPREP23469 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPREP23469 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPREP23469 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPREP23469 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPREP23469 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPREP23469 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPREP23469 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPREP23469 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPREP23469 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPREP23469 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPREP23469 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPREP23469 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPREP23469 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPREP23469 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPREP23469 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPREP23469 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPREP23469 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPREP23469 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPREP23469 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPREP23469 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPREP23469 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPREP23469 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPREP23469 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPREP23469 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPREP23469 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPREP23469 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPREP23469 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPREP23469 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPREP23469 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPREP23469 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPREP23469 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPREP23469 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPREP23469 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPREP23469 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPREP23469 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPREP23469 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPREP23469 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPREP23469 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPREP23469 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPREP23469 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPREP23469 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPREP23469 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
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