Protein–RNA interactions for Protein: P17947

SPI1, Transcription factor PU.1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPI1P17947 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPI1P17947 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPI1P17947 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPI1P17947 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPI1P17947 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPI1P17947 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPI1P17947 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPI1P17947 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPI1P17947 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPI1P17947 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPI1P17947 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPI1P17947 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPI1P17947 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPI1P17947 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPI1P17947 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPI1P17947 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPI1P17947 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPI1P17947 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPI1P17947 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPI1P17947 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPI1P17947 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPI1P17947 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPI1P17947 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPI1P17947 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPI1P17947 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPI1P17947 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPI1P17947 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPI1P17947 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPI1P17947 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPI1P17947 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPI1P17947 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPI1P17947 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPI1P17947 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPI1P17947 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPI1P17947 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPI1P17947 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPI1P17947 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPI1P17947 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPI1P17947 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPI1P17947 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPI1P17947 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPI1P17947 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPI1P17947 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPI1P17947 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPI1P17947 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPI1P17947 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPI1P17947 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPI1P17947 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPI1P17947 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPI1P17947 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPI1P17947 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPI1P17947 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPI1P17947 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SPI1P17947 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SPI1P17947 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SPI1P17947 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPI1P17947 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPI1P17947 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPI1P17947 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPI1P17947 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPI1P17947 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SPI1P17947 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPI1P17947 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPI1P17947 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPI1P17947 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPI1P17947 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPI1P17947 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPI1P17947 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPI1P17947 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPI1P17947 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPI1P17947 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPI1P17947 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPI1P17947 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPI1P17947 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPI1P17947 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPI1P17947 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPI1P17947 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPI1P17947 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPI1P17947 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPI1P17947 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPI1P17947 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPI1P17947 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPI1P17947 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPI1P17947 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPI1P17947 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPI1P17947 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPI1P17947 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPI1P17947 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPI1P17947 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPI1P17947 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPI1P17947 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SPI1P17947 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SPI1P17947 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPI1P17947 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SPI1P17947 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPI1P17947 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPI1P17947 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPI1P17947 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPI1P17947 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPI1P17947 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms