Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGB4P16144 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGB4P16144 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGB4P16144 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGB4P16144 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGB4P16144 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGB4P16144 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGB4P16144 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGB4P16144 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGB4P16144 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGB4P16144 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGB4P16144 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGB4P16144 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGB4P16144 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGB4P16144 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGB4P16144 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGB4P16144 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGB4P16144 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGB4P16144 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGB4P16144 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGB4P16144 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGB4P16144 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGB4P16144 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGB4P16144 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGB4P16144 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGB4P16144 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGB4P16144 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGB4P16144 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGB4P16144 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGB4P16144 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGB4P16144 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGB4P16144 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGB4P16144 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGB4P16144 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGB4P16144 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGB4P16144 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGB4P16144 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGB4P16144 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGB4P16144 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGB4P16144 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGB4P16144 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGB4P16144 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGB4P16144 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGB4P16144 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGB4P16144 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGB4P16144 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGB4P16144 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGB4P16144 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGB4P16144 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGB4P16144 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGB4P16144 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGB4P16144 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGB4P16144 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGB4P16144 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGB4P16144 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGB4P16144 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGB4P16144 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGB4P16144 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGB4P16144 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGB4P16144 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGB4P16144 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGB4P16144 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGB4P16144 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGB4P16144 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGB4P16144 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGB4P16144 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGB4P16144 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGB4P16144 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGB4P16144 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGB4P16144 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGB4P16144 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGB4P16144 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGB4P16144 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGB4P16144 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGB4P16144 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGB4P16144 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGB4P16144 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGB4P16144 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGB4P16144 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGB4P16144 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGB4P16144 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGB4P16144 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGB4P16144 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGB4P16144 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGB4P16144 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGB4P16144 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGB4P16144 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGB4P16144 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGB4P16144 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGB4P16144 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGB4P16144 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGB4P16144 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGB4P16144 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGB4P16144 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGB4P16144 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGB4P16144 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGB4P16144 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGB4P16144 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGB4P16144 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGB4P16144 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms