Protein–RNA interactions for Protein: P15924

DSP, Desmoplakin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,871 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSPP15924 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DSPP15924 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DSPP15924 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DSPP15924 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DSPP15924 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DSPP15924 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DSPP15924 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
DSPP15924 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DSPP15924 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DSPP15924 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DSPP15924 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DSPP15924 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DSPP15924 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DSPP15924 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DSPP15924 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DSPP15924 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DSPP15924 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DSPP15924 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DSPP15924 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DSPP15924 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
DSPP15924 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DSPP15924 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DSPP15924 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DSPP15924 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DSPP15924 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DSPP15924 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DSPP15924 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DSPP15924 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DSPP15924 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DSPP15924 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DSPP15924 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DSPP15924 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
DSPP15924 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DSPP15924 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DSPP15924 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DSPP15924 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DSPP15924 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DSPP15924 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DSPP15924 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DSPP15924 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DSPP15924 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DSPP15924 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DSPP15924 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
DSPP15924 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DSPP15924 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
DSPP15924 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DSPP15924 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DSPP15924 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DSPP15924 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DSPP15924 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DSPP15924 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DSPP15924 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DSPP15924 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DSPP15924 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DSPP15924 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DSPP15924 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DSPP15924 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DSPP15924 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DSPP15924 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DSPP15924 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
DSPP15924 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DSPP15924 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
DSPP15924 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DSPP15924 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DSPP15924 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DSPP15924 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DSPP15924 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DSPP15924 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DSPP15924 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DSPP15924 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DSPP15924 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DSPP15924 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DSPP15924 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DSPP15924 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DSPP15924 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DSPP15924 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DSPP15924 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DSPP15924 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DSPP15924 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DSPP15924 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DSPP15924 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DSPP15924 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DSPP15924 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
DSPP15924 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DSPP15924 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DSPP15924 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DSPP15924 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DSPP15924 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DSPP15924 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
DSPP15924 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DSPP15924 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DSPP15924 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DSPP15924 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DSPP15924 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DSPP15924 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DSPP15924 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DSPP15924 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DSPP15924 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DSPP15924 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
DSPP15924 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms