Protein–RNA interactions for Protein: P13804

ETFA, Electron transfer flavoprotein subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFAP13804 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ETFAP13804 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ETFAP13804 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ETFAP13804 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ETFAP13804 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ETFAP13804 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ETFAP13804 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ETFAP13804 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ETFAP13804 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ETFAP13804 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ETFAP13804 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ETFAP13804 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ETFAP13804 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ETFAP13804 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ETFAP13804 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ETFAP13804 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ETFAP13804 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ETFAP13804 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ETFAP13804 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ETFAP13804 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ETFAP13804 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ETFAP13804 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ETFAP13804 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ETFAP13804 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ETFAP13804 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ETFAP13804 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ETFAP13804 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ETFAP13804 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ETFAP13804 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ETFAP13804 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ETFAP13804 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ETFAP13804 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ETFAP13804 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ETFAP13804 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ETFAP13804 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ETFAP13804 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ETFAP13804 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ETFAP13804 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ETFAP13804 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ETFAP13804 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ETFAP13804 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ETFAP13804 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ETFAP13804 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ETFAP13804 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ETFAP13804 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ETFAP13804 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ETFAP13804 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ETFAP13804 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ETFAP13804 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ETFAP13804 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ETFAP13804 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ETFAP13804 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ETFAP13804 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ETFAP13804 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ETFAP13804 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ETFAP13804 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ETFAP13804 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ETFAP13804 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ETFAP13804 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ETFAP13804 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ETFAP13804 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ETFAP13804 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ETFAP13804 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
ETFAP13804 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ETFAP13804 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ETFAP13804 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ETFAP13804 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ETFAP13804 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ETFAP13804 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ETFAP13804 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ETFAP13804 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ETFAP13804 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ETFAP13804 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ETFAP13804 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ETFAP13804 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ETFAP13804 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ETFAP13804 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ETFAP13804 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ETFAP13804 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ETFAP13804 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ETFAP13804 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ETFAP13804 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ETFAP13804 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ETFAP13804 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ETFAP13804 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ETFAP13804 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ETFAP13804 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ETFAP13804 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ETFAP13804 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ETFAP13804 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ETFAP13804 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ETFAP13804 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ETFAP13804 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ETFAP13804 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ETFAP13804 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ETFAP13804 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ETFAP13804 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ETFAP13804 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ETFAP13804 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ETFAP13804 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms