Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms