Protein–RNA interactions for Protein: P11686

SFTPC, Pulmonary surfactant-associated protein C, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPCP11686 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFTPCP11686 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFTPCP11686 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFTPCP11686 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFTPCP11686 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SFTPCP11686 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFTPCP11686 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFTPCP11686 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFTPCP11686 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SFTPCP11686 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SFTPCP11686 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SFTPCP11686 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SFTPCP11686 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SFTPCP11686 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SFTPCP11686 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SFTPCP11686 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SFTPCP11686 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SFTPCP11686 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SFTPCP11686 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SFTPCP11686 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SFTPCP11686 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SFTPCP11686 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SFTPCP11686 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SFTPCP11686 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SFTPCP11686 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SFTPCP11686 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SFTPCP11686 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SFTPCP11686 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SFTPCP11686 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SFTPCP11686 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SFTPCP11686 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SFTPCP11686 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SFTPCP11686 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SFTPCP11686 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SFTPCP11686 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SFTPCP11686 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SFTPCP11686 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SFTPCP11686 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SFTPCP11686 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SFTPCP11686 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SFTPCP11686 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SFTPCP11686 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SFTPCP11686 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SFTPCP11686 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SFTPCP11686 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SFTPCP11686 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SFTPCP11686 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SFTPCP11686 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SFTPCP11686 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SFTPCP11686 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SFTPCP11686 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFTPCP11686 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFTPCP11686 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFTPCP11686 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFTPCP11686 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFTPCP11686 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFTPCP11686 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFTPCP11686 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SFTPCP11686 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFTPCP11686 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFTPCP11686 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFTPCP11686 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFTPCP11686 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFTPCP11686 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFTPCP11686 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFTPCP11686 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFTPCP11686 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFTPCP11686 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SFTPCP11686 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SFTPCP11686 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFTPCP11686 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFTPCP11686 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SFTPCP11686 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFTPCP11686 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SFTPCP11686 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFTPCP11686 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFTPCP11686 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFTPCP11686 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFTPCP11686 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFTPCP11686 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFTPCP11686 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SFTPCP11686 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SFTPCP11686 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFTPCP11686 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFTPCP11686 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SFTPCP11686 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFTPCP11686 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SFTPCP11686 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFTPCP11686 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFTPCP11686 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFTPCP11686 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFTPCP11686 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFTPCP11686 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFTPCP11686 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFTPCP11686 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFTPCP11686 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFTPCP11686 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFTPCP11686 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFTPCP11686 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFTPCP11686 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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