Protein–RNA interactions for Protein: P10911

MCF2, Proto-oncogene DBL, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2P10911 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MCF2P10911 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MCF2P10911 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MCF2P10911 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MCF2P10911 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MCF2P10911 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MCF2P10911 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MCF2P10911 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MCF2P10911 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MCF2P10911 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MCF2P10911 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MCF2P10911 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MCF2P10911 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MCF2P10911 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MCF2P10911 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MCF2P10911 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MCF2P10911 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MCF2P10911 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MCF2P10911 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MCF2P10911 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MCF2P10911 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
MCF2P10911 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
MCF2P10911 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MCF2P10911 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MCF2P10911 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MCF2P10911 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MCF2P10911 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MCF2P10911 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
MCF2P10911 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MCF2P10911 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MCF2P10911 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MCF2P10911 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MCF2P10911 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MCF2P10911 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
MCF2P10911 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MCF2P10911 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MCF2P10911 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MCF2P10911 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MCF2P10911 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MCF2P10911 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MCF2P10911 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MCF2P10911 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MCF2P10911 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MCF2P10911 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MCF2P10911 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MCF2P10911 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MCF2P10911 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MCF2P10911 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MCF2P10911 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCF2P10911 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCF2P10911 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCF2P10911 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCF2P10911 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCF2P10911 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCF2P10911 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCF2P10911 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCF2P10911 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCF2P10911 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCF2P10911 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCF2P10911 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCF2P10911 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCF2P10911 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCF2P10911 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCF2P10911 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCF2P10911 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCF2P10911 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCF2P10911 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCF2P10911 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCF2P10911 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCF2P10911 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCF2P10911 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCF2P10911 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCF2P10911 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCF2P10911 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCF2P10911 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCF2P10911 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCF2P10911 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCF2P10911 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCF2P10911 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCF2P10911 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCF2P10911 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCF2P10911 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCF2P10911 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCF2P10911 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCF2P10911 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCF2P10911 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCF2P10911 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCF2P10911 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCF2P10911 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCF2P10911 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCF2P10911 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCF2P10911 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCF2P10911 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCF2P10911 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCF2P10911 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCF2P10911 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCF2P10911 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
MCF2P10911 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCF2P10911 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
MCF2P10911 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms