Protein–RNA interactions for Protein: P0CJ79

ZNF888, Zinc finger protein 888, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 500 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF888P0CJ79 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF888P0CJ79 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
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